Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PctpP53808 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PctpP53808 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PctpP53808 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PctpP53808 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PctpP53808 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PctpP53808 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PctpP53808 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PctpP53808 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PctpP53808 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PctpP53808 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PctpP53808 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PctpP53808 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PctpP53808 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PctpP53808 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PctpP53808 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PctpP53808 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PctpP53808 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PctpP53808 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PctpP53808 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PctpP53808 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PctpP53808 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PctpP53808 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PctpP53808 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PctpP53808 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PctpP53808 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PctpP53808 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PctpP53808 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PctpP53808 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PctpP53808 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PctpP53808 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PctpP53808 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PctpP53808 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PctpP53808 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PctpP53808 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PctpP53808 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PctpP53808 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PctpP53808 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PctpP53808 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PctpP53808 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PctpP53808 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PctpP53808 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PctpP53808 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PctpP53808 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PctpP53808 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PctpP53808 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PctpP53808 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms