Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Map3k1P53349 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms