Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SqleP52019 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SqleP52019 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SqleP52019 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SqleP52019 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SqleP52019 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SqleP52019 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SqleP52019 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SqleP52019 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SqleP52019 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SqleP52019 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SqleP52019 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SqleP52019 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SqleP52019 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SqleP52019 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SqleP52019 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SqleP52019 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SqleP52019 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SqleP52019 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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SqleP52019 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SqleP52019 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SqleP52019 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SqleP52019 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SqleP52019 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SqleP52019 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SqleP52019 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SqleP52019 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SqleP52019 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SqleP52019 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SqleP52019 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SqleP52019 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SqleP52019 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SqleP52019 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SqleP52019 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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