Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtshP49935 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtshP49935 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtshP49935 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtshP49935 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtshP49935 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtshP49935 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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CtshP49935 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtshP49935 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtshP49935 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CtshP49935 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtshP49935 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtshP49935 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtshP49935 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CtshP49935 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtshP49935 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CtshP49935 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CtshP49935 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CtshP49935 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CtshP49935 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtshP49935 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtshP49935 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtshP49935 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtshP49935 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtshP49935 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtshP49935 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtshP49935 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms