Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc3P49135 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms