Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Edn3P48299 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms