Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gli1P47806 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gli1P47806 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gli1P47806 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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