Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrprbP47758 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrprbP47758 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SrprbP47758 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrprbP47758 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms