Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Mmp9P41245 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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