Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
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Rpl28P41105 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
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