Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VhlP40338 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VhlP40338 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
VhlP40338 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
VhlP40338 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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VhlP40338 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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VhlP40338 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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