Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lig1P37913 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms