Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd1P33215 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms