Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SsbP32067 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SsbP32067 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SsbP32067 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SsbP32067 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SsbP32067 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SsbP32067 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SsbP32067 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SsbP32067 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SsbP32067 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SsbP32067 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SsbP32067 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SsbP32067 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SsbP32067 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SsbP32067 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SsbP32067 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SsbP32067 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SsbP32067 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SsbP32067 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SsbP32067 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SsbP32067 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SsbP32067 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SsbP32067 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms