Protein–RNA interactions for Protein: P31361

Pou3f3, POU domain, class 3, transcription factor 3, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f3P31361 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pou3f3P31361 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pou3f3P31361 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pou3f3P31361 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pou3f3P31361 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f3P31361 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms