Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms