Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccnd3P30282 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms