Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pabpc1P29341 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pabpc1P29341 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pabpc1P29341 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms