Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms