Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxraP28700 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxraP28700 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RxraP28700 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RxraP28700 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RxraP28700 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RxraP28700 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RxraP28700 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RxraP28700 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RxraP28700 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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