Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
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