Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
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