Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RarbP22605 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RarbP22605 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RarbP22605 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms