Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prim1P20664 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prim1P20664 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms