Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NefhP19246 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NefhP19246 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms