Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18530 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18530 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18530 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18530 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18530 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18530 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18530 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18530 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18530 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18530 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18530 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18530 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18530 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18530 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18530 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18530 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18530 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18530 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18530 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18530 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18530 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18530 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18530 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18530 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18530 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
P18530 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18530 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18530 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18530 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18530 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18530 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18530 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18530 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18530 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18530 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18530 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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