Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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