Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pou4f1P17208 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms