Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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