Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P10404 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P10404 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms