Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Abcc5-204ENSMUST00000115547 5372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Chd8-201ENSMUST00000089752 8190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Qrich2-204ENSMUST00000208602 7260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Muc19-202ENSMUST00000160242 9104 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Olfr731-203ENSMUST00000214152 5572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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