Protein–RNA interactions for Protein: P0C7A0

Khdc1b, KH homology domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1bP0C7A0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1bP0C7A0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms