Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z5

Putative UPF0730 protein encoded by LINC00643 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C1Z5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P0C1Z5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P0C1Z5 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P0C1Z5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms