Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna9P09235 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms