Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
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