Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb3P09026 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb3P09026 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb3P09026 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb3P09026 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb3P09026 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb3P09026 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb3P09026 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb3P09026 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb3P09026 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb3P09026 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb3P09026 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb3P09026 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb3P09026 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb3P09026 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb3P09026 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb3P09026 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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