Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TtrP07309 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms