Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P04212 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04212 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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