Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P01747 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P01747 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P01747 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P01747 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P01747 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P01747 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P01747 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P01747 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P01747 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P01747 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P01747 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P01747 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P01747 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P01747 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P01747 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P01747 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P01747 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P01747 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P01747 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P01747 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P01747 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P01747 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P01747 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P01747 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P01747 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
P01747 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
P01747 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P01747 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
P01747 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P01747 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P01747 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P01747 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P01747 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P01747 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P01747 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P01747 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P01747 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P01747 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P01747 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P01747 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P01747 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P01747 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P01747 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
P01747 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
P01747 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms