Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01655 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01655 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01655 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01655 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01655 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01655 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01655 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01655 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01655 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01655 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01655 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01655 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01655 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01655 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01655 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01655 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01655 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01655 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01655 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01655 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01655 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01655 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01655 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01655 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01655 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01655 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01655 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01655 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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