Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01649 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01649 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01649 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01649 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01649 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01649 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01649 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01649 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01649 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01649 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01649 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01649 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01649 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P01649 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P01649 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01649 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01649 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01649 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01649 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01649 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01649 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01649 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01649 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01649 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01649 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01649 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01649 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01649 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01649 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01649 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01649 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01649 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01649 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01649 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01649 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01649 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01649 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01649 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01649 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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P01649 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01649 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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P01649 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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P01649 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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P01649 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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P01649 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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P01649 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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P01649 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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P01649 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01649 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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P01649 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01649 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01649 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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