Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BlmO88700 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BlmO88700 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BlmO88700 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BlmO88700 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BlmO88700 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BlmO88700 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BlmO88700 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
BlmO88700 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
BlmO88700 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BlmO88700 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BlmO88700 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BlmO88700 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BlmO88700 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BlmO88700 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BlmO88700 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BlmO88700 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BlmO88700 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BlmO88700 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BlmO88700 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BlmO88700 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BlmO88700 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BlmO88700 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BlmO88700 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BlmO88700 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BlmO88700 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BlmO88700 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BlmO88700 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BlmO88700 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BlmO88700 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BlmO88700 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BlmO88700 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BlmO88700 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BlmO88700 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BlmO88700 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BlmO88700 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BlmO88700 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BlmO88700 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BlmO88700 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BlmO88700 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BlmO88700 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BlmO88700 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BlmO88700 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BlmO88700 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BlmO88700 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BlmO88700 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BlmO88700 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BlmO88700 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BlmO88700 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BlmO88700 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BlmO88700 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BlmO88700 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BlmO88700 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BlmO88700 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BlmO88700 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BlmO88700 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BlmO88700 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms