Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms