Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms