Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.3 ms