Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copb2O55029 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copb2O55029 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copb2O55029 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms