Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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