Protein–RNA interactions for Protein: O35973

Per1, Period circadian protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per1O35973 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Per1O35973 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Per1O35973 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Per1O35973 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Per1O35973 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Per1O35973 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Per1O35973 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Per1O35973 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Per1O35973 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Per1O35973 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Per1O35973 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Per1O35973 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Per1O35973 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Per1O35973 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Per1O35973 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Per1O35973 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Per1O35973 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Per1O35973 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Per1O35973 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Per1O35973 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Per1O35973 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Per1O35973 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Per1O35973 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Per1O35973 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Per1O35973 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Per1O35973 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Per1O35973 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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