Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag2O35638 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms