Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx1aO35526 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms